Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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