Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TREX1Q9NSU2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms