Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYLDQ9NQC7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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