Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SALL3Q9BXA9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms