Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SORT1Q99523 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms