Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf72Q96LT7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms