Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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C2orf48Q96LS8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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C2orf48Q96LS8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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C2orf48Q96LS8 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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C2orf48Q96LS8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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C2orf48Q96LS8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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C2orf48Q96LS8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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C2orf48Q96LS8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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