Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SERAC1Q96JX3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms