Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRIQ1Q96JM4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms