Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATXN7L3BQ96GX2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATXN7L3BQ96GX2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms