Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms