Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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