Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
APOBEC4Q8WW27 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms