Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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