Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KIAA1549LQ6ZVL6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549LQ6ZVL6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms