Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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LINC00299Q6ZSB3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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LINC00299Q6ZSB3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LINC00299Q6ZSB3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LINC00299Q6ZSB3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LINC00299Q6ZSB3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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