Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM259Q4ZIN3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM259Q4ZIN3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms