Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms