Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHD9Q3L8U1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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