Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNA2Q15822 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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