Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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PCM1Q15154 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCM1Q15154 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.2 ms