Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
R3HDM1Q15032 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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