Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHPRHQ149N8 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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