Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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TRAF1Q13077 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF1Q13077 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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