Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXC1Q12948 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXC1Q12948 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXC1Q12948 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXC1Q12948 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXC1Q12948 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXC1Q12948 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXC1Q12948 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXC1Q12948 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXC1Q12948 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXC1Q12948 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FOXC1Q12948 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXC1Q12948 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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