Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTCQ00610 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms