Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HBBP68871 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HBBP68871 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HBBP68871 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms