Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVS71-1P61550 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms