Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPAP53621 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPAP53621 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms