Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA4P48058 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA4P48058 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms