Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-FP30511 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms