Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD10P28358 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD10P28358 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms