Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRGP23470 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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