Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRDP23468 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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