Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms