Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRPRAP08240 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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