Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLDN11O75508 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLDN11O75508 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLDN11O75508 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLDN11O75508 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLDN11O75508 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLDN11O75508 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLDN11O75508 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLDN11O75508 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CLDN11O75508 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CLDN11O75508 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN11O75508 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN11O75508 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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