Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SNPHO15079 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 OR4A48P-201ENST00000531359 391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SNPHO15079 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SNPHO15079 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SNPHO15079 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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SNPHO15079 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNPHO15079 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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