Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SUPT5HO00267 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms