Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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