Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms