Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SH3BP1Q9Y3L3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SH3BP1Q9Y3L3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SH3BP1Q9Y3L3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SH3BP1Q9Y3L3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1Q9Y3L3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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