Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRPF3Q9ULD4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms