Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM5BQ9UGL1 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms