Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK3Q9UBP4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms