Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms