Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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POLR2J2Q9GZM3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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POLR2J2Q9GZM3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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POLR2J2Q9GZM3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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POLR2J2Q9GZM3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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POLR2J2Q9GZM3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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POLR2J2Q9GZM3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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POLR2J2Q9GZM3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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POLR2J2Q9GZM3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
POLR2J2Q9GZM3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
POLR2J2Q9GZM3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
POLR2J2Q9GZM3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
POLR2J2Q9GZM3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
POLR2J2Q9GZM3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
POLR2J2Q9GZM3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
POLR2J2Q9GZM3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
POLR2J2Q9GZM3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
POLR2J2Q9GZM3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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