Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSDMCQ9BYG8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSDMCQ9BYG8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms