Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCGF6Q9BYE7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms