Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRRTQ9BXP5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms